Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcf2Q99LE6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcf2Q99LE6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Abcf2Q99LE6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms