Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rnf34Q99KR6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf34Q99KR6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms