Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tm4sf4Q91XD3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tm4sf4Q91XD3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm4sf4Q91XD3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms