Protein–RNA interactions for Protein: Q91W29

Cox4i2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i2Q91W29 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cox4i2Q91W29 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox4i2Q91W29 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox4i2Q91W29 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox4i2Q91W29 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox4i2Q91W29 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox4i2Q91W29 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox4i2Q91W29 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox4i2Q91W29 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox4i2Q91W29 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox4i2Q91W29 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms