Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3il1Q8VDV3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3il1Q8VDV3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms