Protein–RNA interactions for Protein: Q8K467

Tmie, Transmembrane inner ear expressed protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmieQ8K467 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TmieQ8K467 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TmieQ8K467 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TmieQ8K467 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TmieQ8K467 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TmieQ8K467 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TmieQ8K467 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TmieQ8K467 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TmieQ8K467 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms