Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrit1Q8K099 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrit1Q8K099 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrit1Q8K099 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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