Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lancl3Q8CD19 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lancl3Q8CD19 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lancl3Q8CD19 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lancl3Q8CD19 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lancl3Q8CD19 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lancl3Q8CD19 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lancl3Q8CD19 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms