Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8W7

A930004D18Rik, MCG147224, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930004D18RikQ8C8W7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930004D18RikQ8C8W7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms