Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lmo3Q8BZL8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmo3Q8BZL8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmo3Q8BZL8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmo3Q8BZL8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms