Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc30Q8BVF4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc30Q8BVF4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms