Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snapc4Q8BP86 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Snapc4Q8BP86 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Snapc4Q8BP86 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snapc4Q8BP86 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snapc4Q8BP86 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snapc4Q8BP86 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snapc4Q8BP86 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snapc4Q8BP86 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Snapc4Q8BP86 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snapc4Q8BP86 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms