Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Grik4Q8BMF5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grik4Q8BMF5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik4Q8BMF5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 794.6 ms