Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
6820408C15RikQ8BJX2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
6820408C15RikQ8BJX2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms