Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pja2Q80U04 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pja2Q80U04 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pja2Q80U04 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms