Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim17Q7TPM3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim17Q7TPM3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms