Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms