Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rph3alQ768S4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rph3alQ768S4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms