Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot1Q6ZQ08 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms