Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn2Q6PHP6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrn2Q6PHP6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn2Q6PHP6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms