Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc82Q6PG04 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc82Q6PG04 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms