Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrt3Q6PE13 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrt3Q6PE13 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms