Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp2d40Q6P8N9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp2d40Q6P8N9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms