Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac4Q6NZM9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac4Q6NZM9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.6 ms