Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3bQ6NWW9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc3bQ6NWW9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms