Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
N4bp1Q6A037 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
N4bp1Q6A037 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms