Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn13Q64512 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ptpn13Q64512 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn13Q64512 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms