Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou4f3Q63955 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms