Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nup62Q63850 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nup62Q63850 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup62Q63850 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms