Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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