Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb6Q60692 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb6Q60692 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms