Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bbs12Q5SUD9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms