Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRX1

Tom1l2, TOM1-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l2Q5SRX1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tom1l2Q5SRX1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tom1l2Q5SRX1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms