Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mdc1Q5PSV9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mdc1Q5PSV9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mdc1Q5PSV9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms