Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rapgef6Q5NCJ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rapgef6Q5NCJ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rapgef6Q5NCJ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms