Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Esf1Q3V1V3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Esf1Q3V1V3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Esf1Q3V1V3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms