Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf3Q3UYV8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms