Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87499Q3UX49 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87499Q3UX49 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87499Q3UX49 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms