Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rtl4Q3URY0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl4Q3URY0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms