Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc33Q3ULW6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc33Q3ULW6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms