Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ulk3Q3U3Q1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ulk3Q3U3Q1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
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