Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srebf2Q3U1N2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.6 ms