Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TchpQ3TVW5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms