Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CiartQ3TQ03 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CiartQ3TQ03 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms