Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdlim7Q3TJD7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdlim7Q3TJD7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms