Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Ccdc138Q0VF22 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc138Q0VF22 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1305.5 ms