Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
StumQ0VBF8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
StumQ0VBF8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms