Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NeblQ0II04 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NeblQ0II04 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms