Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms