Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax5Q02650 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.1 ms